Le grand orgue de la basilique est un Cavaillé-Coll datant de 1872, il a été inauguré cette même année par Charles-Marie Widor, célèbre organiste parisien. Cet orgue possède 3 claviers manuels et un pédalier. Il est composé de 36 registres. Le buffet de style Louis XV et a été réalisé en 1768, le grand buffet a été agrandi sur les côtés par Cavaillé-Coll afin d'y loger les jeux de la pédale.